愛狗人士購買海豹油餵食寵物，引起倫理及健康問題的爭議。福爾摩莎動物權利小組發言人黃艾婷表示，海豹油都是給人食用，不見得適合狗狗，況且產品包裝完全不提海豹油脂含有高濃度的汞及多氯聯苯，長期服用下，健康堪虞。

    　考量健康安全與動物福利，動保團體呼籲官員、立委硬起來，按照《野生動物保護法》的授權規定，要求農委會及經濟部國貿局公告禁止海豹油輸入。但農委會按照國際保育標準，目前並無限制輸入的打算。衛生署食品藥物管理局統計，最近三年以來，國內進口廿九批海豹油原料共六萬八千公噸，以及七十五批海豹油膠囊約二萬九千公噸，超過九成進口自加拿大，在台灣都是以「食品」類別登記，不得宣稱療效。

    　台灣動物社會研究會主任陳玉敏認為，各式進口的海豹油具有廣告療效的嫌疑，衛生單位罰了又罰，但業者根本罰不怕。幾乎每家進口海豹油都會強調富含 Omega-3不飽和脂肪酸，福爾摩莎動物權利小組發言人黃艾婷表示，科學研究證實，人工培養的微藻比海豹油或魚油更無汙染。

    　動物社會研究會分析加拿大二○○三至二○○九年海豹油出口資料，發現超過七成的海豹油外銷亞洲，其中南韓排名第一，占四十二％，其次為中國（廿六％）、台灣（四％）。

    　動保團體要求政府禁止加拿大海豹油輸入台灣，但農委會林務局野生動物保育科科長林國彰表示，我國與華盛頓公約（ＣＩＴＥＳ)同步，加拿大海豹並不屬於保育類物種，其相關產品各國都可自由交易，我國目前也不打算特別加以限制。